重庆中国三峡博物馆是首批国家一级博物馆、中央地方共建国家级博物馆。前身为1951年成立的西南博物院，1955年更名为重庆市博物馆, 2000年经国务院办公厅批准设立重庆中国三峡博物馆。建筑面积4.5万平方米，展厅面积2.1万平方米，年均接待观众170万人次。现有馆藏文物11.48万余件套(实有28万余件)，涵盖35个文物门类，常设《壮丽三峡》《远古巴渝》《重庆·城市之路》等展览11个，年均推出临时展览30个。

重庆红岩革命历史博物馆于2007年1月19日正式成立,由红岩革命纪念馆、歌乐山革命纪念馆、重庆特园民主党派历史陈列馆3个场馆组成。红岩革命纪念馆主要包括中共中央南方局暨八路军重庆办事处旧址、曾家岩50号、《双十协定》签字处—桂园、宋子文公馆等25处革命遗址。歌乐山革命纪念馆主要包括白公馆监狱旧址、渣滓洞监狱旧址、“一一·二七”死难烈士之墓、松林坡杨虎城将军殉难地、蒋家院子秘密囚室等26处文物遗址及景点。

重庆自然博物馆是自然科技类博物馆。含新馆(建筑面积30,842平方米，展区面积16,252平方米)、老馆(中国西部科学院旧址，全国重点文物保护单位) 2处馆址。为国家一级博物馆、国家AAAA级旅游景区,是“全国科普教育基地”“中国古生物学会全国科普教育基地”“国家自然资源科普基地”“重庆市青少年教育基地”“重庆市爱国主义教育基地”“重庆市科普教育基地”，年均接待观众200万。

大足石刻是中国古代石窟艺术巅峰之作，具有极高的历史、艺术、科学价值，1999年12月，列入《世界遗产名录》。大足石刻博物馆藏品主要包括以北山、宝顶山、南山、石门山、石篆山等“五山”石窟为代表的野外石窟寺遗存，以及文物库房藏品两部分。石窟寺遗存现公布为各级文物保护单位多达75处，造像5万余尊，铭文10万余字。文物库房藏品现有673件（套），实有6489件。

重庆三峡移民纪念馆位于万州区江南新区，是全国唯一一座为纪念三峡工程百万大移民而修建的专题性纪念馆，现为国家一级博物馆、全国爱国主义教育基地、全国首批中小学研学教育实践基地、中华民族红色文化基因库首批试点单位、国家AAAA景区。纪念馆背依翠屏山，面临长江，建筑外观造型独特，外形由棱角分明，宛若长江边耸立的岩石。